代谢组学与蛋白互作技术平台

代谢组学与蛋白互作
技术平台

 简介

公共技术服务中心代谢组学与蛋白互作技术平台为支撑研究所科研创新工作而组建,也为上海生命科学区域中心各研究所以及院内外其他科研单位或者企业开展技术服务。 

平台可满足生物大分子、代谢小分子、挥发性及半挥发性化合物定性定量分析需求。 

平台仪器设备注重新的测试技术与方法的研究和自身能力的提升,充分发挥大型测试仪器的功能,更好地为科研工作服务。 

平台成立以来,多次获得中科院、上海市的各类奖项。 

 服务内容

 大分子化合物定性和定量分析

蛋白质鉴定、蛋白质非标记定量、蛋白质标记定量、磷酸化修饰位点鉴定、糖基化修饰位点鉴定、乙酰化修饰位点鉴定、棕榈酰化修饰位点鉴定、特殊修饰位点鉴定与定量等。

 小分子化合物定性和定量分析

植物激素、核苷及修饰核苷、核苷酸、花生四烯酸、类胡萝卜素、维生素、辅酶、糖酵解、三羧酸、氨基酸、初级代谢物与次生代谢物定性定量分析,靶向和非靶向代谢组学、靶向和非靶向脂质组学等,挥发性和半挥发性化合物的检测。

 提供生物大分子和小分子样品前处理实验室及SOP

 提供前处理平台,定期开展样品前处理、仪器操作技能及前沿技术介绍等培训讲座

      测试服务检测流程

    使用仪器前,课题组须提前一周完成网上预约登记 (OA系统

     质谱实验室主要仪器设备 【所内用户预约推荐使用 OA系统

    ...
    nano timsTOF Pro 2
    在线预约 仪器功能
    ...
    Eclipse_protein
    在线预约 仪器功能
    ...
    Q Exactive HF-X protein
    在线预约 仪器功能
    ...
    QTRAP 6500 Plus_104
    在线预约 仪器功能
    ...
    Q Exactive Plus_small molecule104
    在线预约 仪器功能
    ...
    Q Exactive_UV_small molecule104
    在线预约 仪器功能
    ...
    Orbitrap Fusion Lumos
    在线预约 仪器功能
    ...
    Orbitrap Q Exactive
    在线预约 仪器功能
    ...
    QTRAP 6500 plus
    在线预约 仪器功能
    ...
    GC-QTOF 7890-7200B
    在线预约 仪器功能
    ...
    GC-MS 7890-5977
    在线预约 仪器功能
    ...
    BRUKER 核磁共振波谱仪
    在线预约 仪器功能
    ...
    质谱引导的自动纯化系统
    在线预约 仪器功能

     前处理实验室

    为方便各个课题组进行样品前处理,并确保样品前处理过程的规范化,平台配备了设施齐全的前处理室。同时,平台可提供常用的样品前处理标准操作规程SOP。

    蛋白前处理SOP 小分子化合物前处理SOP
    蛋白质提取 初生代谢物前处理
    FASP酶解 次生代谢物前处理
    胶内酶解(考染、银染) 代谢组学样品前处理
    样品分级、纯化、脱盐 脂质组学样品前处理
    磷酸化多肽富集 样品纯化富集
    二硫键鉴定 极性小分子衍生化

     前处理实验室预约流程及注意事项

    首次使用前处理实验室,需联系实验室管理人员进行操作规范培训。

    1. 前处理实验室实施预约机制,需提前一周与实验室负责人沟通,沟通之后再在网上(OA系统)预约登记。
    2. 预约仪器后如有特殊情况须提前一个工作日取消预约,并电话通知仪器管理人员。
    3. 使用仪器必须征得管理人员的同意,不得擅自使用。
    4. 实验室禁止大声喧哗和进食。仪器在使用过程中和使用完毕必须保持仪器和桌面整洁,请勿遗留样品和丢弃物。
    5. 使用仪器必须认真登记,包括开始和结束时间,仪器状态等信息。
    6. 如在使用过程中仪器出现故障,须立即停止操作,第一时间联系管理人员,保持仪器现有状态。

    Tel: 021-54924211 
    Email:  荆莲艳 lyjing@cemps.ac.cn    

     前处理实验室主要仪器设备

    为方便各个课题组进行样品前处理,平台配备了设施齐全的前处理室。同时,平台可提供常用的样品前处理SOP。

    ...
    真空离心浓缩仪
    在线预约
    ...
    混匀仪
    在线预约
    ...
    氮吹浓缩仪
    在线预约
    ...
    培养箱IN55
    在线预约
    ...
    IN55孵化箱
    在线预约
    ...
    空冷型台式低速离心机
    在线预约
    ...
    多管旋涡混合仪
    在线预约
    ...
    旋转培养混合器
    在线预约
    ...
    12位固相萃取真空装置
    在线预约
    ...
    电子天平 
    在线预约
    ...
    多管旋涡混合仪
    在线预约

     工作人员介绍

    徐晓燕

    平台技术负责人 高级工程师 
    电话:54924211 
    Email: xyxu@cemps.ac.cn

    制定检测标准,提升技术服务内容和检测方式及审核;仪器技术人员任务安排;报告审核等技术性事务负责;以及基于仪器的技术分析服务,包括相关技术的定期培训。

    胡文利

    平台主管 正高级实验师 
    电话: 54924211 
    Email: wlhu@cemps.ac.cn

    负责平台日常事务管理,协调平台技术人员建立规范的检测和服务流程(样品登记制度及报告生成时间等);协助中心主任进行本平台人员聘用和年度考核的实施、经费管理、设施运行和年度预决算等;以及基于仪器的技术分析服务,包括相关技术的定期培训。

    刘益宁

    高级工程师 
    电话: 54924188 
    Email: ynliu@cemps.ac.cn

    仪器技术人员,侧重于小分子化合物检测;以及基于仪器的技术分析服务,包括相关技术的定期培训;参与对外服务工作。

    张玉路

    正高级实验师 
    电话: 54924188 
    Email: ylzhang@cemps.ac.cn 

    仪器技术人员,侧重于样品纯化分离技术工作。对外服务项目负责。包括相关技术的定期培训。

    蓝文贤

    高级工程师
    电话: 54924188 
    Email: lanwx@cemps.ac.cn 

    仪器技术人员,负责核磁共振分析仪的运行和维护,以及基于仪器的分析服务,包括相关技术的定期培训。

    王姗姗

    工程师 
    电话: 54924211 
    Email: sswang@cemps.ac.cn 

    仪器技术人员,侧重于大分子化合物检测;以及基于仪器的技术分析服务,包括相关技术的定期培训。

    荆莲艳

    实验师 
    电话: 54924211 
    Email: lyjing@cemps.ac.cn 

    仪器技术人员,侧重于小分子化合物检测,兼顾样品前处理室管理和仪器维护。以及基于仪器的分析服务,包括相关技术的定期培训。

    高媛媛

    实验师 
    电话: 54924211 
    Email: yygao@cemps.ac.cn 

    仪器技术人员,侧重于大分子化合物检测,以及质谱相关样品前处理技术服务;包括相关技术的定期培训。

    王智慧

    助理工程师
    电话: 54924211 
    Email: zhwang@cemps.ac.cn

    仪器技术人员,侧重于小分子化合物检测,以及质谱相关样品前处理技术服务;包括相关技术的定期培训。

      Quick Link

     平台简介
     服务内容
     测试服务检测流程
     质谱实验室仪器设备
     前处理实验室
     前处理实验室预约
     前处理实验室设备
     工作人员介绍

    公共技术服务中心

    地址:中国上海枫林路300号(200032)  
    电话:86-21-54924211   
    传真:86-21-54924015   
    Email: cfc@cemps.ac.cn 

    Copyright © 2002-2020 中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所 版权所有 沪ICP备05033115号

    Back to top