代谢组学与蛋白互作技术平台

代谢组学与蛋白互作
技术平台

 简介

公共技术中心代谢组学与蛋白互作技术平台作为研究所科研创新的重要技术支撑,不仅服务于本中心科研工作,同时面向上海生命科学区域中心各研究所及院内外科研单位和企业提供专业的技术服务,构建了开放共享的科研服务平台体系。

平台配备先进的分析设备,可全面满足生物大分子、代谢小分子定性定量以及挥发性/半挥发性化合物检测等多元化分析需求,形成了覆盖分子互作到代谢调控的完整技术链条。

我们始终致力于新型检测技术的研发和方法优化,通过深度开发大型仪器功能潜力,持续提升平台技术水平,确保为科研工作提供最前沿的技术支持和服务保障。

平台自成立以来,凭借规范的管理体系和优质的服务质量,多次获得中科院和上海市的各类奖项。建立了覆盖样品前处理、质量控制、检测分析及数据处理的标准化流程,为科研工作提供可靠的技术支撑。

 服务内容

 大分子化合物定性和定量分析

蛋白质鉴定、蛋白质非标记定量、蛋白质标记定量、磷酸化修饰位点鉴定、糖基化修饰位点鉴定、乙酰化修饰位点鉴定、棕榈酰化修饰位点鉴定、特殊修饰位点鉴定与定量等。

 小分子化合物定性和定量分析

植物激素、核苷及修饰核苷、核苷酸、花生四烯酸、类胡萝卜素、维生素、辅酶、糖酵解、三羧酸、氨基酸、初级代谢物与次生代谢物定性定量分析,靶向和非靶向代谢组学、靶向和非靶向脂质组学等,挥发性和半挥发性化合物的检测。

 提供生物大分子和小分子样品前处理实验室及SOP

 提供前处理平台,定期开展样品前处理、仪器操作技能及前沿技术介绍等培训讲座

      测试服务检测流程

    使用仪器前,课题组须提前一周完成网上预约登记 (中国科学院仪器共享管理平台

     质谱实验室主要仪器设备

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    tims TOF Ultra
    在线预约 仪器功能
    ...
    nano timsTOF Pro 2
    在线预约 仪器功能
    ...
    Eclipse_protein
    在线预约 仪器功能
    ...
    Q Exactive HF-X protein
    在线预约 仪器功能
    ...
    QTRAP 6500 Plus_104
    在线预约 仪器功能
    ...
    Q Exactive Plus_small molecule104
    在线预约 仪器功能
    ...
    Q Exactive_UV_small molecule104
    在线预约 仪器功能
    ...
    Orbitrap Fusion Lumos
    在线预约 仪器功能
    ...
    Orbitrap Q Exactive
    在线预约 仪器功能
    ...
    QTRAP 6500 plus
    在线预约 仪器功能
    ...
    GC-QTOF 7890-7200B
    在线预约 仪器功能
    ...
    GC-MS 7890-5977
    在线预约 仪器功能
    ...
    BRUKER 核磁共振波谱仪
    在线预约 仪器功能
    ...
    质谱引导的自动纯化系统
    在线预约 仪器功能

     前处理实验室

    为方便各个课题组进行样品前处理,并确保样品前处理过程的规范化,平台配备了设施齐全的前处理室。同时,平台可提供常用的样品前处理标准操作规程SOP。

    蛋白前处理SOP 小分子化合物前处理SOP
    蛋白质提取 初生代谢物前处理
    FASP酶解 次生代谢物前处理
    胶内酶解(考染、银染) 代谢组学样品前处理
    样品分级、纯化、脱盐 脂质组学样品前处理
    磷酸化多肽富集 样品纯化富集
    二硫键鉴定 极性小分子衍生化

     前处理实验室预约流程及注意事项

    首次使用前处理实验室,需联系实验室管理人员进行操作规范培训。

    1. 前处理实验室实施预约机制,需提前一周与实验室负责人沟通,沟通之后再在网上(http://yuyue.sippe.ac.cn/)预约登记。
    2. 预约仪器后如有特殊情况须提前一个工作日取消预约,并电话通知仪器管理人员。
    3. 使用仪器必须征得管理人员的同意,不得擅自使用。
    4. 实验室禁止大声喧哗和进食。仪器在使用过程中和使用完毕必须保持仪器和桌面整洁,请勿遗留样品和丢弃物。
    5. 使用仪器必须认真登记,包括开始和结束时间,仪器状态等信息。
    6. 如在使用过程中仪器出现故障,须立即停止操作,第一时间联系管理人员,保持仪器现有状态。

    Tel: 021-54924211 
    Email:  荆莲艳 lyjing@cemps.ac.cn    

     前处理实验室主要仪器设备

    为方便各个课题组进行样品前处理,平台配备了设施齐全的前处理室。同时,平台可提供常用的样品前处理SOP。

    ...
    真空离心浓缩仪
    在线预约
    ...
    混匀仪
    在线预约
    ...
    氮吹浓缩仪
    在线预约
    ...
    培养箱IN55
    在线预约
    ...
    IN55孵化箱
    在线预约
    ...
    空冷型台式低速离心机
    在线预约
    ...
    多管旋涡混合仪
    在线预约
    ...
    旋转培养混合器
    在线预约
    ...
    12位固相萃取真空装置
    在线预约
    ...
    电子天平 
    在线预约
    ...
    多管旋涡混合仪
    在线预约
    ...
    CV600真空低温离心浓缩仪
    在线预约

     工作人员介绍

    徐晓燕

    平台技术负责人 高级工程师 

    电话:54924211 
    Email: xyxu@cemps.ac.cn

    设计质谱实验方案,优化数据采集与分析全流程;仪器选型论证、方法开发及前沿应用拓展;统筹仪器升级与共享效能优化;支撑科研攻关及技术转化;推进人才梯队建设与团队发展。

    胡文利

    平台主管 正高级实验师 

    电话: 54924211 
    Email: wlhu@cemps.ac.cn

    负责平台日常事务管理;协助中心主任完成人员聘用、年度考核及团队建设,监督平台设施安全运行;统筹平台经费使用、年度预决算编制,优化设备运维及资源分配;基于气相色谱质谱联用(GC-MS)的技术支撑、培训与讲座。

    张玉路

    正高级实验师 

    电话: 54924188 
    Email: ylzhang@cemps.ac.cn 

    仪器技术人员,侧重于样品纯化分离:运用分析/半制备液相色谱开发样品纯化方案及方法优化,结合高分辨质谱实现小分子分离与结构鉴定,负责仪器维护、用户培训及教育课程开发。

    蓝文贤

    高级工程师

    电话: 54924188 
    Email: lanwx@cemps.ac.cn 

    仪器技术人员,负责核磁共振波谱仪的运行和维护,以及基于仪器的实验方案设计、定量方法开发验证分析等服务,承担部分蛋白质样品前处理工作。

    王姗姗

    高级工程师 

    电话: 54924211 
    Email: sswang@cemps.ac.cn 

    仪器技术人员,侧重于蛋白质质谱分析全流程工作,负责低丰度蛋白检测、翻译后修饰分析及相互作用研究;开发蛋白质组学方法,构建标准化检测流程与质控体系;开展技术培训,协助实验方案设计与优化。

    荆莲艳

    实验师 

    电话: 54924211 
    Email: lyjing@cemps.ac.cn 

    仪器技术人员,侧重于小分子化合物定性定量分析,负责样品前处理、数据采集与分析;建立标准化分析流程;负责样品前处理实验室日常运行及液质联用仪维护;组织液质联用技术培训与操作指导。

    高媛媛

    实验师 

    电话: 54924211 
    Email: yygao@cemps.ac.cn 

    仪器技术人员,侧重于单细胞检测技术,开发适用于植物样本的单细胞蛋白质组学平台;构建自动化分选-质谱联用流程,提升通量与稳定性,组织相关技术培训,支撑高水平研究成果。

    刘笑松

    工程师

    电话: 021-54924211
    Email: xsliu@cemps.ac.cn

    仪器技术人员,侧重于单细胞检测技术,开发适用于植物样本的单细胞蛋白质组学平台;构建自动化分选-质谱联用流程,提升通量与稳定性,组织相关技术培训,支撑高水平研究成果。

      Quick Link

     平台简介
     服务内容
     测试服务检测流程
     质谱实验室仪器设备
     前处理实验室
     前处理实验室预约
     前处理实验室设备
     工作人员介绍

    公共技术服务中心

    地址:中国上海枫林路300号(200032)  
    电话:86-21-54924211   
    传真:86-21-54924015   
    Email: cfc@cemps.ac.cn 

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